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医院系统的洁净室用于手术室，也就是我们现在所说的医院手术室净化工程。开始它只是在矫形手术中获得广泛应用,因为矫形手术时间较长,易于引起。控制水平较理想的是使用手术台附近的空气洁净度达到100级。我国《洁净室施工及验收规范》(以下简称“规范”)强调，新风必须遵循三级过滤的原则。一般建议使用顶部空气过滤系统,它能覆盖至少3m×3m的面积,从而将手术台和人包括在内。
洁净室作为医院重要的功能分区之一，其工程质量直接影响到医院的使用和对患者的。要提高医院洁净室的工程质量，必须从设计、施工和维护三方面同时重视。
1.选择经过培训的施工队伍
洁净室施工涉及装饰、暖通、电气和气体等，施工人员须对洁净室施工规范、施工工艺、施工质量有认识，否则，施工质量很难得到保障。
2.洁净室内密封控制重点
洁净室内密封控制重点内容是围护结构的密封施工质量，如板材与板材之间应均匀涂密封胶，达到严密不漏风;洁净室内的嵌壁器械柜与墙体之间、壁板上安装的插座、开关、烟感探测器、照明箱体及灯带、观片灯等都需要用密封胶进行密封，且器械柜中的各种管道和箱体之间也都必须采用可靠和有效的密封措施。1层流式空调室内空气以一定速度在同一方向流动时，所形成的气流称为层流。
3.2 手术室还应设3个出入口，即出入口、工作人员出入口、污物出口。尽量做到隔离、洁污分流，避免。
3.3 吹淋室
国外有资料介绍，洁净室中的灰尘80%来自于人，因此，人员的净化十分重要。在一定吹淋风速、吹淋时间的条件下，空气吹淋对清除人员身上的灰尘有明显作用。吹淋室可分室式（单人室或双人室）和通道式两种。因此，净化手术室必须要严格管理，才能保证有效的功能，实现切断手术途径和避免围手术期手术的终目的。一般情况下，单人吹淋室可连续接纳20～30人次，超过20人宜采用双人吹淋室或通道吹淋室。
