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电离室复合损失
如果选择了适当的极化电压，复合效应便可忽略。但是复合损失不仅与极化电压有关，还与电离室灵敏体积中空气的电离密度有关，即与剂量率有关。由于离子复合，空腔内的电荷收集效率不高，需用修正因子。如果详细研究，电离室的复合效应与其形状、收集电压、以及辐射产生电荷的速度有关。当测量加速时，辐射是脉冲式的，脉冲瞬间的辐射剂量率远远大于其平均剂量率，复合修正因子变得相当重要。
电离室的污染对检测的影响
在使用火焰电离检测器时要求其电离室有极高的清洁度，电离室内的任何组件，包括电离室的内壁和顶盖，电极和点火器等组件都不应该有任何有机物或灰尘的污染，在对火焰电离检测器电离室内的任何组件或内壁进行清洗后，如果您的手指重新接触了它们，在点火后您就会发现基线上出现了频繁的噪音和波动。
FID电离室的污染的影响
实验室中的灰尘对火焰电离检测器的污染有着严重的影响，要知道我们周围的灰尘通常含有大量从我们所穿的鞋底带来的土和灰尘，这些灰尘恰好是我们鞋底磨下的棉、皮革、橡胶或塑料的粉末，或者是从马路上带入的灰尘，那些灰尘大多是路面上由车辆的轮胎磨下的橡胶粉末，所有这些大多是含碳的有机物粉末，当它们进入火焰电离检测器后便会在氢火焰中电离并给出毛剌状的基线噪音，因此经常打扫实验室是件必要的工作，尤其是对地面的擦洗。
电离室组成部分
电离室主要由外部导电室壁和中心测量电极组成，室壁内是充满自由空气的空腔。室壁和测量电极之间由高绝缘材料及防护电极分隔开，用于减小在施加极化电压时的漏电流。电离室施加极化电压后充满电。当它暴露于辐射时，气腔中的空气分子被辐射电离，产生正离子和低能电子。低能电子与空气中的氧分子结合成为负离子。正负离子被收集，导致电离室电极上的电荷减少。电荷(单位：C，库仑)的减少与剂量成正比，产生的电流(单位：A，安培)强弱与剂量率成正比。