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两虫是2种严重危害水质安全的致病性单细胞原生动物，其卵囊或孢囊具有个体微小、致病剂量低、抵抗环境选择性压力强、易造成两虫病爆发流行等特点，呈多发性分布，因而需要用两虫检测系统进行检测以保证水质。
首先，便于协同调整水处理方案，水中两虫越多就需更多的处理以期降低其在水中的含量。
其次，保护公众，因为两虫会影响饮用者身体健康，疾病后的救治成本远高于提前预防成本；
另外，一旦发生规模性得病，供水公司必将承担相应的法律责任。
SDI：
用标准仪测量水中沉淀物密度指数和胶体物质浓度，间接反映杂质颗粒对反渗透膜的阻隔速度。值越小，阻塞速度越慢，值越大，阻塞速度越快。
COD：
化学物质消耗是指在一定条件下用强氧化剂处理水样时消耗的氧化剂量。COD水中有机物含量越高，污染越严重。
8.OD：生物需氧量是微生物在有氧条件下，由于微生物的作用，在水中完全氧化分解时可分解有机物的耗氧量。BOD能反映水中有机物的含量和污染程度。
两虫检测的现状是怎么样的？
一是降低水处理要求，如果水中的隐孢子虫较多，则需要多处理，以达到降低的目的；二是保护公众，因为隐孢子虫可以威胁你的生命。另外，从公众的压力来看，所有消费者都希望饮水安全。后，在疾病爆发后，成本极高，如影响游客，关闭公共服务，要求煮饮，一旦，对供水公司和基础研究的目的有潜在的法律影响。
为确保饮用水安全，实施高质量供水，国家建设部在2005年6月1日正式实施的《城市供水水质标准》（CJ/T206-2005）中，增加了一鞭毛虫和隐孢子虫的微生物指标。要求：加1/10升水。在2006年12月29日发布的《生活饮用水卫生标准》（GB5749-2006）中，国家增加了一鞭毛虫和隐孢子虫的微生物指标。要求：加1/10升水。在实验方法的洗涤/浓缩部分，首先推荐了Envirochek方法（Pall公司），还有其他供选方法。为了完成的检测要求，开展有效的两虫检测工作，建立两虫检测实验室势在必行。我国一些供水企业和研究部门已经开始了这项工作。
由于贾第鞭毛虫和隐孢子虫卵囊和孢囊的表面包裹着一层较厚的囊壁，因此具有非常强的环境抗性。常规消毒工艺的氯浓度不能有效灭活隐孢子虫和贾第鞭毛虫，它们通过水厂构筑物进入供水管网，威胁人们健康。传统检测手段有严重的滞后性，不能及时准确的报告水中有关两虫的信息。
两虫的危害
隐孢子虫和贾第鞭毛虫产生的卵囊和孢囊对环境有很大的抗性，人体只要摄入几个就会生病。
贾第鞭毛虫致病剂量为10~100个活孢囊，隐孢子虫致病剂量仅为1~10个活卵囊。